Darbo tikslas. Įvertinti egzomo sekoskaitos tyrimo veiksmingumą ir klinikinę naudą klinikinėje praktikoje tiriant pacientus, kuriems yra epilepsija ar traukulių.
Metodai. Per 30 mėnesių laikotarpį taikant išsamų diagnostinį egzomo sekoskaitos metodą, įskaitant mitochondrinio genomo variantų ir kopijų skaičiaus pokyčių analizę, ištirti 87 pacientai, kuriems yra epilepsija ar traukulių. Egzomo variantų filtravimas, analizavimas ir interpretavimas atliktas dviem etapais: pirmame etape pritaikytas remiantis EpiGene duomenų baze sudarytas 862 genų, susijusių su monogeninėmis ligomis, pasireiškiančiomis epilepsija ar traukuliais, rinkinys, antrajame - analizuoti nefiltruoti egzomo variantai.
Rezultatai. Atlikus diagnostinį egzomo sekoskaitos tyrimą, nustatyti 47 patogeniniai, tikėtina patogeniniai ir neaiškios klinikinės reikšmės variantai. 43 pacientams nustatyti patogeniniai ir tikėtina patogeniniai variantai ir patvirtinta genetinės ligos diagnozė (diagnostinis veiksmingumas 49 %). Nustatyti trys nauji su monogenine epilepsija siejami genai - SOX5, SCN3A ir UBA5. Vienuolikai pacientų (1Į/47, 23 %) diagnozuotos paveldimos medžiagų apykaitos ligos. Daugelis diagnozuotų ligų - neseniai atrastos ar labai retos. Pacientų kohorta pasižymėjo plačia fenotipine įvairove, daugeliui pacientų buvo nespecifinių ir tokių pačių simptomų ar požymių arba ne visas galimų simptomų ir požymių spektras dažniausiai dėl jauno paciento amžiaus. Ypač didelė diagnostinio egzomo sekoskaitos tyrimo klinikinė nauda pacientams, kuriems diagnozuotos ligos, gydomos taikant specifinį gydymą (12/47, 26 % diagnozuotų pacientų, 11/87, 13 % visų pacientų).
Išvados. Taikant išsamų diagnostinio egzomo sekoskaitos tyrimo metodą, sudarytą atsižvelgiant į genetinę ir klinikinę monogeninių ligų, pasireiškiančių epilepsija ar traukuliais, įvairovę, apimantį įvairius molekulinės patologijos tipus ir pakopinį egzomo duomenų analizavimą pritaikant išsamų genų rinkinį, pasiekiamas didelis diagnostinis veiksmingumas ir nustatoma naujų su epilepsija siejamų genų.
